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  1. 保姆级KEGG数据库教程!医学人如何入门KEGG?信号通路分析必学功 …

    Aug 18, 2022 · 1. KEGG PATHWAY 这部分应该就是大家最熟悉的啦,也是KEGG数据库最核心的部分。 它包含了与通路相关的各种信息,我们解螺旋也有相关课程教大家使用,在此就不赘述。 2. KEGG …

  2. 为啥目标基因在kegg富集分析时,没有kegg pathway通路,只有kegg …

    在进行KEGG富集分析时,如果发现目标基因只富集到了KEGG BRITE分类而不是经典的KEGG pathway,这可能意味着以下几种情况: 1. 数据特异性: 你的基因集可能富含一些较为新颖或特定 …

  3. GO和KEGG分析怎么筛选自己想要的基因啊? - 知乎

    GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是常用的基因功能注释和通路分析工具。 如果想筛选自己想要的基因进行GO和KEGG分析,可以按照以下步骤进行: 获取 …

  4. KEGG 怎么用? - 知乎

    KEGG GENOME 截止9月1日,这部分共收集了6105种物种(534 eukaryotes, 5272 bacteria, 299 archaea)的基因组信息和完整的基因组序列,并会根据EST数据集进行补充。

  5. 在KEGG分析中,富集到的Pathway比较少(个位数),怎么办? - 知乎

    如题,在KEGG分析中,富集到的Pathway,符合q值<0.05的Pathway数量比较少(只有个位数甚至1条),请问这时候作图的话展示的Pathw…

  6. KEGG得出信号通路之后去哪里查找每条通路的作用? - 知乎

    小编整理批量绘制KEGG通路图的代码,可以做下面几个分析 1)KEGG富集分析 2)基于富集分析结果,挑选显著富集的通路,展示通路图,将结果保存为png或者pdf。 3)批量绘制最显著topN (N可以 …

  7. 单细胞测序中GO、KEGG、GSEA 分析三个高级分析有什么区别? - 知乎

    单细胞测序中GO、KEGG、GSEA分析是三种常用的高级分析方法,它们各有特点和应用场景,以下是它们的主要区别: GO分析 1.定义与目的: Gene Ontology(GO)是一个国际标准化的基因功能分类 …

  8. kegg气泡图能看出通路是上调还是下调吗? - 知乎

    Nov 5, 2024 · 如题一般来说,KEGG气泡图本身并不直接显示基因表达水平的变化方向(上调或下调),但它可以帮助你识别出哪些通路可能与你的研究问题相关,并进一步进行深入分析。 …

  9. 请问KEGG特异性通路图怎么看? - 知乎

    请问KEGG特异性通路图怎么看? 刚入行小白提问,一个物种的KEGG特异性通路图,基因标注有白框的和绿框的。 绿框的是一定存在的基因吗? 白框的是一定不存在的基因吗? 这里面有什么门道吗? …

  10. 求go/kegg富集分析可视化网站 或者方法? - 知乎

    其中,KEGG Pathway 子数据库因专门收录不同物种的基因通路信息(也是科研中最常用的模块),才让 “KEGG = 通路分析” 的印象深入人心。 下面我们结合具体实例,带大家看看 GO 三大分类和 KEGG …